1991 yılında Pendik İmam Hatip Lisesi nin bir şubesi olarak açıldı. 1995 yılında Tuzla İmam-Hatip Lisesi olarak müstakil oldu.
1999 yılında komisyon kararı ile Tuzla Halil Türkkan İmam Hatip Lisesi adını aldı. 2003-2004 öğretim yılında Anadolu İmam Hatip-Lisesi bölümü açıldı.
2012-2013 Eğitim Öğretim yılında İmam Hatip Ortaokulu bölümü açıldı. Lise ve ortaokul bölümlerimiz ile bağlı beş şubemizde, 76 sınıflık kapasitemiz ve 1974 öğrenci ile A-B-C Blok binalarında 2014-2015 eğitim öğretim yılından itibaren sadece kız öğrencilerle eğitim ve öğretime devam etmekteyiz.
Örgün eğitim faaliyetlerimize ilave olarak yaygın eğitim kapsamında Mesleki Açık Lise dersleri de yapılmaktadır. Yaklaşık 200 kız öğrencimiz Mesleki Açık Lisede öğrenim görmektedir.